Нижегородский губернский деятель
Родился в Нижнем Новгороде, в семье вице-губернатора Бориса Ефимовича Прутченко.
Окончил Школу гвардейских подпрапорщиков и кавалерийских юнкеров (1851 г.).
В 1851 – 1860 годах находился на военной службе в Российской армии.
В 1861 – 1869 годах жил в городе Княгинине, служил в должности мирового посредника, был княгининским уездным предводителем дворянства.
В 1869 – 1872 годах – Нижегородский губернский предводитель дворянства.
Был избран почётным мировым судьёй по Нижегородскому и Княгининскому уездам, председателем съезда мировых судей Нижегородского судебного мирового округа, почётным попечителем Нижегородской гимназии и Нижегородского дворянского института, Нижегородского приюта для призрения бедных дворян Нижегородской губернии.
Почётный гражданин города Княгинина.
В 1872 – 1886 годах – губернатор Псковской губернии.
Отец Прутченко Сергея Михайловича.
Жил в городе Пскове, похоронен в Иоанно-Предтеченском монастыре.
Награды: ордена Св. Владимира 3-й степени (1876); Св. Станислава 1-й степени (1879); Св. Анны 1-й степени (1882).